Важнейшие даты и события в истории института:
17 июля 1918 года – приказом Главного Комиссара всех военно-учебных заведений Российской Республики № 140 учреждены Первые советские инструкторские военно-железнодорожные курсы с дислокацией в г. Торжке Тверской губернии.
15 июля 1919 года – состоялся первый выпуск курсантов. Они получили звание помощника взводного командира Железнодорожных войск, что соответствовало званию взводного командира пехоты и кавалерии.
26 сентября 1920 года – приказом Реввоенсовета Республики № 1956 курсы переведены на положение школы командного состава РККА и переименованы в Первую советскую военно-железнодорожную школу командного состава.
3 апреля 1921 года – за проявленную стойкость и упорство в борьбе с врагами Советской власти ВЦИК наградил школу Почетным Революционным Красным Знаменем. Приказом Реввоенсовета Республики № 1530 день 17 марта установлен годовым праздником.
28 апреля 1922 года – приказом Реввоенсовета Республики № 1070 школа переведена из Торжка в Петроград с наименованием: "Петроградская (впоследствии Ленинградская) военно-железнодорожная школа для подготовки командного состава".
12 января 1926 года – приказом РВС СССР № 39 за достигнутые успехи в боевой и политической подготовке школе присваивается имя выдающегося полководца М.В. Фрунзе.
23 февраля 1930 года – ЦИК СССР наградил школу вторым Почетным Революционным Красным Знаменем.
19 октября 1930 года – школе присвоено наименование "Краснознаменная школа военных сообщений имени М.В. Фрунзе".
16 марта 1937 года – приказом НКО СССР № 36, школа переименована в Ленинградское Краснознаменное училище военных сообщений имени М.В. Фрунзе.
Июль-август 1941 года – курсанты принимают участие в боевых действиях по охране войскового тыла Северного фронта на Лужском оборонительном рубеже, в подготовке партизанских баз на территории Ленинградской области.
В конце августа 1941 года – училище передислоцируется в г. Шарья и пос. Мантурово Горьковской области. В соответствии с приказом Народного Комиссара Обороны была осуществлена перестройка учебного процесса. Был установлен срок обучения курсантов - 9 месяцев.
Февраль 1943 года – училище переводится в г. Ярославль. Здесь наряду с учебой личный состав участвует в реконструкции железнодорожных линий, ликвидации последствий налетов вражеской авиации, строительстве народнохозяйственных объектов.
16 марта 1943 года – за боевые и трудовые заслуги, успехи в подготовке офицеров для Железнодорожных войск и военных сообщений училище награждено орденом Ленина. Училище стало именоваться: "Ленинградское ордена Ленина Краснознаменное училище военных сообщений имени М.В. Фрунзе ".
Июнь 1945 года – училище возвращается в Ленинград, личный состав принимает активное участие в восстановительных работах на ряде объектов.
С 1946 года – согласно приказу НКО и НКПС от 14 декабря 1945 года устанавливается трехлетний срок обучения курсантов.
Март 1946 года – училищу вручается Знамя части.
Сентябрь 1948 года – состоялся первый послевоенный выпуск молодых офицеров.
1 ноября 1967 года – на территории училища торжественно открыт обелиск "Воспитанникам училища, павшим в боях за свободу и независимость нашей Родины".
17 марта 1968 года – за достигнутые успехи в подготовке офицерских кадров и в связи с 50-летием со дня основания училище награждено Почетной грамотой Президиума Верховною Совета РСФСР.
1969 год – Постановлением Совета Министров СССР от 27.06.1969 г. и приказом МО СССР от 22.07.1969 г. училище преобразовано в Ленинградское высшее ордена Ленина Краснознаменное командное училище Железнодорожных войск и военных сообщений имени М.В. Фрунзе.
Апрель 1970 года – в ознаменование 100-летия со дня рождения В.И. Ленина Центральный Комитет КПСС, Президиум Верховного Совета СССР и Совет Министров СССР за достигнутые показатели в боевой и политической подготовке наградили училище Ленинской юбилейной почетной грамотой.
Декабрь 1972 года – за высокие показатели в боевой и политической подготовке, в ознаменование 50-летия образования Союза ССР училище награждено Юбилейным почетным знаком Центрального Комитета КПСС, Президиума Верховного Совета СССР и Совета Министров СССР и ВЦСПС.
26 июля 1974 года – первый в истории училища выпуск офицеров с высшим образованием.
Сентябрь 1975 года – училище из командного переведено на новую организационно-штатную структуру и стало именоваться Ленинградское высшее ордена Ленина Краснознаменное училище Железнодорожных войск и военных сообщений имени М.В. Фрунзе. Вместо батальонов сформированы командные и инженерные факультеты, создано отделение заочного обучения офицерского состава и специальное отделение по подготовке иностранных военнослужащих.
17 мая 1978 года – за большие успехи в подготовке командных кадров для Железнодорожных войск и военных сообщений и плодотворную работу по коммунистическому воспитанию молодежи комсомольская организация училища занесена в Книгу Почета Центрального Комитета ВЛКСМ.
Май 1985 года – за активное участие в работе по героико-патриотическому воспитанию молодежи училище награждено грамотой и медалью Советского Комитета ветеранов войны.
11 июля 1989 года – Директивой Генерального штаба в училище воссоздан инженерный факультет.
23 октября 1993 года – в соответствии с Постановлением Правительства Российской Федерации № 1072 и приказом Министра обороны № 603 от 28 декабря 1993 года на базе училища с 1 января 1994 года создан Военно-транспортный институт Железнодорожных войск и военных сообщений в качестве государственного общеобразовательного учреждения высшего профессионального образования со сроком обучения 5 лет.
Июнь 1994 года – Военно-транспортный институт Железнодорожных войск и военных сообщений посетил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II.
1 августа 1994 года – произведен первый набор в очную адъюнктуру. Обучение курсантов и слушателей первых курсов началось по новым учебным планам и программам.
Май 1995 года – открыта Аллея Героев Советского Союза и Героев Социалистического труда, выпускников университета.
22 октября 1997 года – в соответствии с Постановлением Правительства Российской Федерации № 1342 Военно-транспортный институт преобразован в Военно-транспортный университет Железнодорожных войск Российской Федерации – военно-образовательное учреждение высшего профессионального образования.
28 марта 1998 года – университет отметил свое 80-летие. Вышел в свет документальный научно-исторический очерк истории Военно-транспортного университета Железнодорожных войск (1918-1998 гг.) "На службе Отечеству".
25 августа 1999 год – решением Военного совета Железнодорожных войск РФ и приказом командующего Железнодорожными войсками РФ № 033 от 3 сентября 1999 года в университете создан Факультет подготовки руководящих кадров Железнодорожных войск.
6 августа 2001 года – в университете торжественно отмечено 150-летие Железнодорожных войск России.
28 августа 2001 года – разъезду 131 км присвоено наименование "Разъезд генерала Омельченко".
19 декабря 2001 года – приказом командующего Железнодорожными войсками Российской Федерации университет определен лучшей воинской частью центрального подчинения Железнодорожных войск РФ среди научно-исследовательских учреждений профессионального образования и ему вручен на вечное хранения вымпел Военного Совета войск "Лучшей воинской части центрального подчинения по итогам года".
2 декабря 2004 года – в соответствии с указаниями Министра обороны РФ от 10 ноября 2004 года № 158/13/4256 произведен прием Военно-транспортного университета Железнодорожных войск Российской Федерации в состав Вооруженных Сил Российской Федерации.
24 декабря 2008 года – распоряжением Правительства Российской Федерации №1951-р университет присоединен к Военной академии тыла и транспорта имени генерала армии А.В. Хрулева в форме обособленного структурного подразделения.
1 октября 2009 года – на основании штата №17/155 переименован в Военно-транспортный институт Железнодорожных войск и военных сообщений.
11 ноября 2009 года – в соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации № 1695-р преобразован в филиал ВАТТ.
1 июля 2011 года – на основании штата №17/400 переименован в филиал ВАТТ (г. Санкт-Петербург, г. Петродворец).
Февраль 2012 года – Петродворцовый филиал ВАТТ.
15 марта 2012 года – на основании приказа Министра обороны Российской Федерации № 545 переименован в Военный институт (Железнодорожных войск и военных сообщений) ВАТТ им. генерала армии А.В. Хрулёва.
21 июня 2012 года – в связи переименованием Федерального государственного казённого военного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Военная академия тыла и транспорта имени генерала армии А.В. Хрулёва» Министерства обороны Российской Федерации в Федеральное государственное казённое военное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Военная академия материально-технического обеспечения имени генерала армии А.В. Хрулёва» Министерства обороны Российской Федерации институт стал Военным институтом (Железнодорожных войск и военных сообщений) Военной академии материально-технического обеспечения им. генерала армии А.В. Хрулёва.
